تیم های مختلفی از جمله تیم پرسپولیس از تیم استقلال به دلیل عبور از سقف قرارداد شکایت کردند اما کمیته انضباطی بعد از بررسی مدارک تیم استقلال اعلام کرد آبی پوشان سقف قرارداد را رعایت کرده اند و مستحق جریمه نقدی نیستند.
باشگاه استقلال بعد از رای کمیته انضباطی مبنی بر بازگشت امتیازات کسر شده از تیم های سپاهان و پرسپولیس اعلام کرد از این پس خود را مکلف به قوانین وضع شده از سوی سازمان لیگ نمی داند.
حالا اما سازمان لیگ تصمیم گرفته است تیم استقلال را به بهانه رعایت سقف قرارداد تشویق کند و سازمان لیگ به فدراسیون فوتبال توصیه کرده است جرایم نقدی در نظر گرفته شده برای تیم هایی که از سقف قرارداد عبور کرده اند را در مناطق محروم هزینه کند.
باشگاه استقلال به بهانه رعایت سقف قرارداد از بازیکنان درخواست کرد مبالغ قرارداد خود را کاهش دهند که خیلی از بازیکنان و هم چنین جواد نکونام این کار را انجام دادند.
